Génomique et informatique : l'impact sur les thérapies et sur l'industrie pharmaceutique

¹ P. KOURILSKY, Préface " Des gènes aux protéines ". Bibliothèque Pour la Science, diffusion Belin.

² Catherine VINCENT. Le Monde . Numéro spécial : Le Siècle.

³ Oui 2. Denoël. 1971.

⁴ Adénine, Thymine, Guanine, Cytosine.

⁵ Le Séquençage. Document fourni par le Centre national de séquençage.

⁶ Le Monde - 3 juin 1998.

⁷ Cf. entretien du rapporteur avec M. Manfred ZORN. Center for bioinformatics and computational genomics. Université de Berkeley, Californie. 2 avril 1999.

⁸ Le Monde . 24 mars 1999.

9 Le génome des organismes eucaryotes tels que les plantes, les animaux, les champignons, les levures, est protégé par une membrane à l'intérieur du noyau de la cellule.

¹⁰ Jean WEISSENBACH. ENA Mensuel n° 285.

¹¹ Françoise FOURY. Revue Gène. 195.1.1997.

¹² ENA Mensuel n° 285.

¹³ Pierre CASELLAS, Directeur du centre d'immunologie de Sanofi Recherche à Montpellier.

¹⁴ Fiche " Informatique et séquençage ". Génoscope.

¹⁵ Laboratoire d'électronique, de technologie et d'instrumentation.

¹⁶ PCR : Polymerase chain reaction ou réaction de polymérisation en chaîne. Ce procédé permet de copier en grande quantité une séquence quelconque d'ADN en un temps très bref.

¹⁷ AMIGO : Présentation générale - Février 1999. LETI/CEA.

¹⁸ AMIGO : Présentation générale - Février 1999. LETI/CEA.

¹⁹ La société Affymetrix a intenté un procès à Incyte Pharmaceuticals et à Synteni. Elle est elle-même attaquée par Hyseq pour deux de ses brevets...

²⁰ J. DANGOUMAU, Professeur des universités, praticien hospitalier, pharmacologie.

²¹ Cf. la thèse de Line BOUREL : " Synthèse combinatoire appliquée à la découverte de nouveaux médicaments ". Université de Lille. 1997.

²² Pour la science . n° 241 Novembre 1997.

²³ Pour la Science . n° 241. Novembre 1997.

²⁴ B. MERRIFIELD a reçu pour ces travaux le prix Nobel de chimie en 1984.

²⁵ André TARTAR. Directeur de la CEREP. L'Usine nouvelle. Hors série. Novembre 1998.

²⁶ Michel KACZOREK. Président de Syntem. L'Usine Nouvelle. Hors série. Novembre 1998.

²⁷ " Une nouvelle stratégie de recherche ". Synthélabo.

²⁸ " Quels antibactériens pour demain ? ", J.-F. DESNOTTES. La Recherche n° 314. Novembre 1998.

²⁹ Rapport de l'OTA (Office of Technology Assessment). 1984.

³⁰ Le kilobase (kb) est une unité de taille correspondant à 1000 paires de bases d'ADN. La taille moyenne d'un gène est de 1 à 2 kb.

³¹ La transduction est le transfert de séquences d'ADN entre différents génomes par l'intermédiaire d'un virus.

³² Séquences situées avant ou après le gène proprement dit sur le filament d'ADN et impliquées dans l'efficacité de la production des protéines.

³³ Pr Alain FISCHER.

³⁴ AFM. Chronique des mille jours de la thérapie génique. N° 6. Novembre 1998.

³⁵ Dr. LEBOULCH (Harvard Medical School, Massachusetts) et Dr. BACHELOT (Centre Léon Bérard. Lyon).

³⁶ Société Gencell RPR.

³⁷ Chronique des mille jours de la thérapie génique. N° 3 mars 1998 ; AFM.

³⁸ " Thérapie génique : thérapie du gène et gène médicament ". Axel KAHN.

³⁹ Source : www.wiley/genetherapy.com . Transgène février 1999.

⁴⁰ Source : L'Usine nouvelle - Hors série - Mars 1999.

⁴¹ " Targeted gene correction : a new strategy for molecular medicine ". S. YE, A. COLE-STRAUSS, B. FRANK, E. KMIEC. Molecular Medicine Today . Oct. 1998.

⁴² Afp, 15 novembre 1998 - Comptes-rendus de l'Académie des Sciences.

⁴³ Note de presse : CEA-INSERM - 30 mars 1998.

⁴⁴ Les cellules dendritiques sont des cellules spécialisées dans la présentation d'antigènes.

⁴⁵ " Immunité antitumorale et perspectives d'immunothérapie ". Marina OSTANKOVITCH, Agnès BUZYN, Sacha GNJATIC, Jeannine CHOPPIN, Jean-Gérard GUILLET (Laboratoire d'immunologie des pathologies infectieuses et tumorales. INSERM, U 445. Médecine thérapeutique. Vol 3. n°  9. Novembre 1997.

⁴⁶ Le pistolet à gènes ou " gene gun " est un appareil permettant de faire pénétrer, à l'intérieur des cellules, l'ADN fixé sur des microparticules d'or.

⁴⁷ Pour la Science . N° 263. Septembre 1999.

⁴⁸ On appelle antigène toute molécule capable d'être reconnue par le système immunitaire et de provoquer une réponse de ce système.

⁴⁹ " Qu'apporte la connaissance du génome de Helicobacter Pylori ? " Agnès LABIGNE, Peter JENKS, Véronique MAZARIN, Marie-Josée QUENTIN-MILLET. La lettre de l'infectiologue . 1998.

⁵⁰ " Attenuation of virulence by disruption of Mycobacterium tuberculosis erp gene ". F-X BERTHET, M. LAGRANDERIE, P. GOUVION, C. LAURENT-WINTER, D. ENSERGUEIX, P. CHAVAROT, F. HOURON, E. MARANGHI, V. PELICIE, D. PORTNOÏ, G. MARCHAL, B. GICQUEL. Science , 23 octobre 1998.

⁵¹ Source : The Scientific future of DNA for immunization. Colloquium of the American Academy of Microbiology. Juin 1996.

⁵² Définition de la pharmacogénomique par le Professeur George POSTE.

⁵³ Tableau et citations extraits et traduits de l'article " This drug's for you ". Business Week. 18 janvier 1999.

⁵⁴ Tableau et citation extraits et traduits de l'article " This drug's for you ". Business Week . 18 janvier 1999.

⁵⁵ J. DANGOUMAU, Professeur des universités, praticien hospitalier, pharmacologie.

⁵⁶ Le technoscope de Biofutur . N° 166. Avril 1997.

⁵⁷ Gènes considérés comme indispensables au développement d'une tumeur.

⁵⁸ New Drug Discovery Technologies. Lehman Brothers.

⁵⁹ " Publique et privée : quelles conditions pour une recherche commune ? " Intervention de François MEYER, directeur de la recherche de Rhône Poulenc Rorer. Cercle institutionnel, 13 octobre 1998.

⁶⁰ Source : Med Ad News, Mai 1997.

Millenium Predictive Medicine.

⁶¹ World Review 1999. The Pharmaceutical Market. IMS ELF, Londres.

⁶² " Les alliés de la biotech. Laboratoires et compagnies de biotechnologie ". Dr. François THOMAS. Pharmaceutiques. Octobre 1998. N° 60.

⁶³ Courrier ANVAR. N° 113. Septembre 1998.

⁶⁴ " Biotechnologies et Santé ". Publication Eurasanté. Lille 1999.

⁶⁵ Source : Les Chiffres clés de la science et de la technologie 1998-1999, Observatoire des sciences et des techniques , Economica, 1998.

⁶⁶ Institut Pasteur : Rapport 1997.

⁶⁷ Institut Pasteur : Rapport 1998.

⁶⁸ Claude GRISCELLI. La Revue Parlementaire . Supplément. 3 ^e trimestre 1998.

⁶⁹ " La technologie et l'innovation " Henri GUILLAUME. Coll. des rapports officiels. Doc. fr. 1998.

⁷⁰ Propos de M. J. BAIXERAS, adjoint du délégué aux entreprises du CNRS, cités dans l'article " Un nouveau statut pour le chercheur créateur d'entreprise ". Les ÉCHOS . 13/01/1999.

⁷¹ Dossier Valorisation. Biofutur n° 183. Novembre 1998.

⁷² Le Monde . 22 septembre 1999.

⁷³ Entretiens du rapporteur avec P. CHAMBON, professeur au Collège de France, directeur de l'Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire. Strasbourg. 11 février 1999.

⁷⁴ " ADN et évolution " Richard MOXON et Christopher WILLS. Pour la Science, n° 257. Mars 1999.

⁷⁵ David BALTIMORE. Prix Nobel de médecine. Intervention au Forum Biovision. Lyon. Mars 1999.

⁷⁶ Nature . 1998. 279.

⁷⁷ " Principe de la lecture électronique de l'hybridation de l'ADN sur support solide ". E. SOUTEYRAND, J.-P. CLOAREC, C. CHICHER, J.-R.  MARTIN.

⁷⁸ Source : Association France-Biotech. Octobre 1999.

⁷⁹ Les biopoles font bouger l'Europe. L'Usine nouvelle . Hors série. Mars 1999.

⁸⁰ Courrier ANVAR . N° 113. Septembre 1998.

⁸¹ L'Usine nouvelle . Hors série. Mars 1999.

⁸² L'Usine nouvelle . Hors série. Mars 1999.

⁸³ Source : Association Alsace Biovalley.

⁸⁴ Elle devra être transposée dans le droit national des États membres au plus tard le 30 juillet 2000.

⁸⁵ Article 5 de la directive 98/44.

⁸⁶ La protection juridique des inventions biotechnologiques après l'adoption de la directive européenne. Laurence TELLIER-LONIEWSKI. Gazette du Palais. 21 janvier 1999.

⁸⁷ " Patent on gene fragments sends researchers a mixed message ". Tony REICHARDT. Nature . Vol. 396. Dec 1998.

⁸⁸ Déclaration d'Arthur HOLDEN, président directeur général du SNP Consortium. 15 avril 1999.

⁸⁹ Les nouveaux métiers des biotechnologies. L. BOURLANDE. La Recherche . Septembre 1998.

⁹⁰ Washington Post . ST Presse de l'Ambassade de France. 7 Juin 1999.

⁹¹ www.infobiogen.fr

⁹² La chorée de Huntington est une maladie neurodégénérative incurable. Elle débute en moyenne vers 40-50 ans, provoquant des mouvements anormaux, des troubles du comportement, un démence et la mort, au bout d'une quinzaine d'années.

⁹³ Jeremy RIFKIN. Dossier Biofutur,. n° 181. Septembre 1998.

⁹⁴ Axel KAHN. Génétique, médecine et société. ENA Mensuel, N° 285.

⁹⁵ La Découverte . Paris. 1998.

⁹⁶ R. COORSH.. Health Insurance Association of America.

⁹⁷ SNP : Single nucleotide polymorphism.

⁹⁸ La France face au défi des biotechnologies : quels enjeux pour l'avenir ? Rapport présenté par M. ROUVILLOIS et M. LE FUR. Conseil économique et social. 1999.

⁹⁹ In Bulletin Unesco. Compte rendu conférence mondiale sur la science, 26 juin-1 ^er juillet 1999.

¹⁰⁰ D'après les réflexions de Mme Claire RODRIGUEZ-LAFRASSE, maître de conférences des universités, particien hospitalier en biochimie et biologie moléculaire. CHU de Lyon.

¹⁰¹ " A hypothetic case in 2010 ". The New England Journal of Medicine . 1 ^er juillet 1999.

¹⁰² Jacques Dangoumau, Professeur des universités, praticien hospitalier, pharmacologie.

¹⁰³ Ethica. N° 28/29. Juin 1999.

¹⁰⁴ Wolff et al. (1990) Science 247: 1465.

¹⁰⁵ FIV : feline immunodeficiency virus.

¹⁰⁶ SIV : simian, immunodeficiency virus.

¹⁰⁷ Ancien vaccinologiste du CNRS.

¹⁰⁸ PowderJect Pharmaceutical a été fondée en 1993 pour exploiter les recherches réalisées à l'Université d'Oxford (Angleterre) et se trouve basée à Madison, Wisconsin.

¹⁰⁹ Petite start-up créée en 1992 en Pennsylvanie, Apollon n'a jamis réussi à devenir publique. Son approche technologique rentrait en conflit avec les brevets de Vical.

¹¹⁰ Cette collaboration s'élève à 40 millions de dollars. Source : Bioworld Today . 26 janvier 1999.

¹¹¹ 4 bases et 20 acides aminés.

¹¹² Le Paradoxe de la Vie. Francis Kaplan La Découverte. Janvier 1995.